Oddelenie molekulárnej biológie a biotechnológií

Cieľom vedeckej práce Oddelenia molekulárnej biológie a biotechnológií je štúdium málo preskúmaných genetických zdrojov so zameraním na izoláciu a charakterizáciu génov s potenciálnym využitím v biotechnológiách; štúdium odpovede rastlín na biotický a abiotický stres a biológia bunkovej steny. Súčasťou metodického portfólia oddelenia sú techniky rekombinantnej DNA, transformácie rastlín, molekulárno-biochemické,  proteomické a  bioinformatické analýzy. Výsledky výskumu oddelenia prispievajú k získavaniu poznatkov v oblasti základného výskumu, a naznačujú aj východiská pre potenciálne biotechnologické využitie.

Oblasti výskumu

Genetické zdroje pre biotechnológie

  • Identifikácia a izolácia génov pre hydrolytické enzýmy zapojených do tráviacich procesov mäsožravých rastlín
  • Analýza biochemických a antimikrobiálnych vlastností produktov týchto génov
  • Analýza transgénnych rastlín s konštitutívnou expresiou skúmaných génov z hľadiska posilnenia ich obrany voči fytopatogénom

Rastliny a stres

  • Štúdium parazitických rastlín, predovšetkým strigolaktónov zahrnutých do medzidruhovej komunikácie s kultúrnymi rastlinami a štúdiom proteómu klíčiacich semien parazitických druhov Phelipanche and Orobanche spp.
  • Výskum vzťahu medzi rastom vodných rastlín v pôde kontaminovanej rádionuklidmi a ich toleranciou voči fytopatogénom so zameraním na oxidačné poškodenie proteínov

Biológia bunkovej steny

  • Úloha extracelulárnych proteínov v skorých štádiách somatickej embryogenézy vybraných ihličnanov

Laboratórium oddelenia molekulárnej biológie a biotechnológii

  • AUTOKLÁV – SA 260 MA (Sturdy Industrial)
    AUTOKLÁV HORIZONTÁLNY malokapacitný   - Laboklav 25M (SHP)
    AUTOKLÁV, PRENOSNÝ S PRÍSLUŠENSTVOM - Prestige Classic Media 12 l (Prestige Medical), 2 ks
    BIOSPEC NANO – (Shimadzu – BioTech)
    CENTRIFÚGA STOLNÁ CHLADENÁ – Universal 32 R (Hettich), 3 ks
    CENTRIFÚGA STOLNÁ NECHLADENÁ – Mikro 200 (Hettich)
    ELEKTROFORETICKÁ APARATÚRA VERTIKÁLNA - Owl P10DS (Thermo Scientific)
    ELEKTROFORETICKÁ APARATÚRA HORIZONTÁLNA malá - kuroGEL Midi 13 Horizontal (VWR Collection)
    ELEKTROFORETICKÝ ZDROJ 1 - EV202 (Consort)
    ELEKTRONICKÉ ANALYTICKÉ DIGITÁLNE VÁHY S INTERNOU KALIBRÁCIOU - AEJ 200-4NM (Kern)
    FLUORIMETER – Synergy H1
    FOTODOKUMENTAČNÝ SYSTÉM – Doc It (UVP)
    HLBOKOMRAZIACI BOX NA -80 °C - UxF300 (REVCO)
    HOMOGENIZÁTOR – TissueLyser II (Qiagen)
    HYBRIDIZAČNÁ PIECKA – 6/12 V (Uni Equip)
    KLIMATIZOVANÁ RASTOVÁ KOMORA - ICH 750 (Memmert)
    KONCENTRÁTOR S ROTOROM- SPEEDVAC - Concentrator plus (Eppendorf)
    LABORATÓRNA TREPAČKA PRE KULTIVÁCIU RASTLÍN S PRÍSLUŠENSTVOM – Advanced 10000-2 (VWR Collection)
    LAMINARNY BOX BIOHAZARD veľký s príslušenstvom - Bio II Advance 6 (Telstar)
    LAMINARNY BOX BIOHAZARD veľký - Aura VF72 (Uniflow)
    LASER SCANER - Typhoon FLA 9500 (GE Healthcare)
    MICROPLATE STRIP Washer – ELP 40 (Bio-Tek Instruments)
    MIKROSKOP S PRÍSLUŠENSTVOM (fotodokumentačný systém, PC, software) – DM 5500D (Leica)
    MIKROSKOP S PRÍSLUŠENSTVOM (fotodokumentačný systém, PC, software) – Axioplan 2 (Zeiss)
    SEKVENÁTOR – ABI Prism 310 (Applied Biosystems)
    SEPARAČNÁ JEDNOTKA - Ettan DALT twelve (GE Healthcare)
    SKENER  - GS 800 Densitometer (Bio-Rad)
    STEREOMIKROSKOP – E 24D (Leica)
    STEREOMIKROSKOP FLUORESCENČNÝ S PRÍSLUŠENSTVOM (fotodokumentačný systém, PC, software) – MZ 10F (Leica)
    TERMOCYKLER – Tetrad 2 (Bio Rad)
    TERMOCYKLER – Primus
    TERMOCYKLER qPCR – LihtCycler Nano (Roche)
    TREPAČKA INKUBOVANÁ S PRÍSLUŠENSTVOM s chladením - Excella E24R (NEW BRUNSWICK)
    TREPAČKA HORIZONTÁLNA – MR-12 (BioSan), 2 ks
    UV SPEKTROFOTOMETER – UV 1800 (Shimadzu)
    UV SPEKTROFOTOMETER – Ultrospec 1000 (Pharmacia BioTech)
    VAKUOVA ODPARKA - HEIDOLPH
    VÝROBNÍK ĽADU